Dicer, Drosha i wyniki u pacjentów z rakiem jajnika czesc 4

Test Wilcoxona zastosowano do porównania rozkładów rangowych zmiennych ciągłych niezgodnych z założeniami normalności. Tabele kontyngencji i dokładny test Fishera posłużyły do oceny związku między śmiercią a zmiennymi kategorycznymi. Sporządzono wykresy Kaplana-Meiera i zastosowano test log-rank w celu określenia różnic między krzywymi przeżycia zgodnie z poziomem ekspresji Dicer i Drosha. Analizy wielowymiarowe przeprowadzono przy użyciu modelu proporcjonalnych hazardów Coxa, aby zbadać wpływ ekspresji Dicer i Drosha na śmierć z powodu choroby, dostosowując się do innych zmiennych towarzyszących. Poprawki Bonferroniego zastosowano w analizach obejmujących wiele porównań. Związek pomiędzy ekspresją genów Dicer i Drosha a przeżyciem był badany w zestawach danych na mikromacierzy poprzez rozdzielenie przypadków z każdej kohorty na grupę o wysokim medianie poziomu ekspresji i grupę o niskim medianie poziomu ekspresji. Istotność statystyczną współczynnika hazardu Cox oszacowano za pomocą testu Wald a (przy użyciu pakietu przeżycie [wersja 2.34] w języku R dla obliczeń statystycznych [wersja 2.6.1]). 25 Statystyka kappa została obliczona w celu oceny zgodność między wynikami RT-PCR a wynikami histochemicznymi. Wszystkie wartości P były dwustronne, a wartość P mniejszą niż 0,05 uważano za wskazującą na istotność statystyczną.
Wyniki
Dicer i Drosha Expression
Zbadaliśmy 111 próbek raka jajnika i 11 łagodnych próbek nabłonkowo-jajnikowych, stosując ilościowy RT-PCR dla mRNA i obliczyliśmy stosunki ekspresji w nowotworach i ekspresję w łagodnych próbkach. Rozkład poziomów mRNA Dicer w próbkach raka jajnika był bimodalny (P = 0,002 w teście Kolmogorova-Smirnowa na normalność) z dwoma pikami w stosunku (0,43 i 4,25). Podział między tymi dwoma subpopulacjami odpowiadał współczynnikowi mRNA Dicer wynoszącemu 1,20. Poziomy mRNA Drosha w próbkach nowotworowych były zgodne z rozkładem normalnym (P = 0,15 w teście Kolmogorova-Smirnowa na normalność), z maksimum odpowiadającym medianowej wartości 1,00. Te odkrycia potwierdzają naszą decyzję o użyciu jako wartości odcięcia dla wysokich i niskich poziomów mRNA Dicer i Drosha w kolejnych analizach.
Poziomy mRNA zmieniały się w próbkach nowotworowych; 60% zmniejszyło mRNA Dicer, a 51% zmniejszyło mRNA Drosha (Tabela w dodatkowym dodatku). U 39% okazów wystąpił spadek poziomu zarówno mRNA Dicer, jak i Drosha. Średni stosunek ekspresji Dicer w próbkach nowotworowych z obniżonymi poziomami mRNA Dicer wynosił 0,27 (zakres, od 0,01 do 1,00, trzy próbki z niewykrywalnymi poziomami), a u pacjentów z obniżonymi poziomami mRNA Drosha wynosił 0,52 (zakres, 0,02 do 1,00, jedna próbka niewykrywalna poziomy). Próbki o podwyższonych poziomach mRNA miały medianę dla Dicer równą 3,38 (zakres, 1,13 do 10,41) i medianę dla Drosha 1,98 (zakres, 1,02 do 18,85).
Aby określić, czy poziomy mRNA odzwierciedlają ekspresję białka, zbadano również podgrupę 32 guzów jajnika za pomocą metod immunohistochemicznych (Figura w Dodatku Aneks). Wynik histochemiczny zgadzał się z ilościowymi wynikami RT-PCR dla obu Dicer (kappa = 1,00, 95% przedział ufności [CI], 1,00 do 1,00) i Drosha (kappa = 0,86, 95% CI, 0,68 do 1,00).
Zbadaliśmy także poziomy mRNA Dicer i Drosha w panelu linii komórkowych raka jajnika
[przypisy: kolonografia, wzór bazetta, ferrytyna badanie cena ]

Powiązane tematy z artykułem: ferrytyna badanie cena kolonografia wzór bazetta